朝阳将海面染成金色，潜艇破浪而行，甲板上众人的影子被拉得很长。李小二扶着小奶娃坐在帆布椅上，递过去一个烤得焦香的红薯：“喏，海里烤不成，陆地版先凑合！”少年咬了口红薯，糖汁顺着嘴角流下，他突然指着远处惊喊：“看！那是什么？”
一道银色身影破水而出，竟是只背生机械鳍的海豚。它围着潜艇打转，发出清脆的鸣叫声，鳍片上闪烁的纹路与基因库的能量波动如出一辙。“是基因守护者改造的生物！”零的机械义眼泛起蓝光，“它在给我们传递信号——有新的威胁正在靠近。”
话音未落，天空突然暗下来。数十架造型狰狞的飞行器从云层中俯冲而下，机身刻满扭曲的符文，喷射口喷出的不是火焰，而是紫色的基因雾。刘老鬼抄起脉冲枪大骂：“狗日的！暗影组织不是覆灭了吗？”郭雅琴举起磁暴步枪，却发现武器在紫色雾气中开始失灵。
“这些雾气会干扰基因频率！”小奶娃挣扎着起身，从背包掏出个竹筒，里面装着发光的萤火虫——正是他改良的基因稳定剂。他将竹筒抛向空中，萤火虫振翅间散发出金色光芒，紫色雾气竟开始消散。飞行器失去掩护，露出下方悬挂的巨型胶囊，里面浸泡着半人半机械的怪物。
“是新型改造体！”零放大画面，怪物的皮肤下跳动着诡异的黑色血管，“它们的基因链经过二次扭曲，比之前的更危险！”郭雅琴当机立断：“李小二、刘老鬼负责击落飞行器，零破解对方的通讯频率，小奶娃...”她看向少年，“保护好基因稳定剂，这是我们的关键防线。”
战斗一触即发。刘老鬼的脉冲枪在天空划出绚丽的弧线，击落两架飞行器。李小二抱着基因震荡弹，看准时机纵身一跃，将炸弹塞进敌机的引擎。爆炸的火光中，他在空中翻了个跟头，落地时还不忘耍帅：“看你李爷的空中杂技！”
零的手指在全息键盘上飞速敲击：“找到了！这些飞行器受海底深处的神秘信号控制，不是暗影组织的技术！”他的机械义眼突然剧烈闪烁，“信号源...来自马里亚纳海沟！”小奶娃听到这个地名，胸前的太阳纹章突然发烫，他的脑海中闪过一幅幅画面：幽深的海沟底部，矗立着巨大的远古建筑，无数发光的基因链条在其中流转。
“我知道那地方！”少年大喊，“是基因文明的遗迹！有人在利用远古力量！”他的话音未落，最大的一架飞行器打开舱门，一个全身笼罩在黑袍中的身影走出来。那人抬手一挥，所有改造体突然融合成一只百米高的巨兽，它的眼睛是两个巨大的基因漩涡，所到之处海水沸腾。
郭雅琴的磁暴步枪终于恢复运作，她瞄准巨兽的眼睛射击，却被漩涡吸走能量。刘老鬼挥舞大刀砍向巨兽的腿部，刀刃却像砍在橡胶上般弹开。李小二急得直跳脚：“这玩意儿刀枪不入，咋打？”小奶娃盯着巨兽身上的基因纹路，突然想起基因库壁画上的古老符号。
“它们害怕纯粹的生命能量！”少年掏出所有基因稳定剂，将其混合成一瓶金色液体，“女娲基因是生命本源，而这些改造体是扭曲的产物！只要...”他将液体泼向巨兽，金色光芒与黑色基因链激烈碰撞。巨兽发出震天的嘶吼，开始分解成无数发光的粒子。
黑袍人见状，冷哼一声消失在空气中。战斗结束后，零检测到神秘信号正在减弱，但马里亚纳海沟深处的能量波动却愈发强烈。小奶娃望着海面，眼神坚定：“我们得去海沟，那里藏着解开所有基因谜题的关键。”郭雅琴握紧拳头，磁暴步枪蓄满能量：“那就准备出发，这一次，无论敌人是谁，我们都要守护住这片土地的基因火种。”
夕阳西下，潜艇调转方向，朝着更神秘的深海驶去。甲板上，李小二又掏出个竹筒，里面装着他偷偷藏的萤火虫：“小奶娃，等这事完了，你可得教我做能打怪兽的烟花！”少年笑着点头，胸前的太阳纹章与海面的波光交相辉映，仿佛预示着新的冒险即将展开。