宋应星的回来让朱由检大为欢喜，朱由检更是直接给大明工部下拨了三百万两白银，将从谋逆的东林人府邸抄没的银两全部给了工部。
皇帝陛下如此大手笔的给工部下拨银子，在百官看来这已经不是什么新鲜事了，而且工部按照皇帝朱由检的旨意，很快开始在南京城外建设军工厂，其中火药和火炮，还有火枪，弹药厂是最重要的四个工厂。
在开始大面修建工厂的同时，朱由检也开始着手一系列新政的改革，眼下乘着东林势力被大大削弱，朱由检的很多新政都要准备在明年执行。
其中就有鼓励商贾的法令，朱由检鼓励商人行商，并且制定了商业行商令，这个行商令的好处就是只要商人得到这个行商令，就可以在一个领域行商，并且明确了赋税，避免了各地官吏无辜收取赋税。
这个行商令其实就是一个商品牌照，行商令分为很多种，也就是明确规定了商人行商的范围。
朱由检需要对商人进行严格的管理，对他们涉足的领域也要有严格的要求，目的就是保证国家的资源能够分配到最需要的地方，就拿现在的生铁来说，就是非常重要的资源，首先供应的就是明军。
朱由检的行商令可以对商业行为进行详细的管理，商人可以向官府申请行商令，行商令上面明确标准了这个商人经营的商品和行商的范围。
比如一个商人是买卖粮食的，那么他的行商令上面经营的项目里面就会标明粮食，其实行商令就是一个营业执照，根据买卖的商品不同，收取对应的费用。
针对不同的领域，行商令需要审核的等级也是不同的，如果一个普通百姓就是想要在路边卖茶叶蛋，那审核会非常容易，到了官府缴纳五文钱，然后备份一下身份就可以得到行商令。
如果一个人想要买卖海盐，那么他的行商令的审批可能就要严格很多，还有钱庄之类的，也需要严格的审批，甚至需要到南京来审批，地方官府都无权批准，而且还要缴纳押金。
朱由检制定行商令的目的就是为了明确将商业区分开来，这个时代对于商业的准入门槛非常低，尤其是一些非常重要的行业，钱庄、海商、矿产、盐铁、工坊等，只要你有钱，就可以随便开设，根本就不需要任何手续，也没有监管。
监管不到位，不仅会产生危机，比如一个钱庄老板带着钱跑了，让存钱的百姓遭受重大损失。
或者是钱庄老板将钱挪作它用，最后亏损了无法偿还，这些都需要监管。
在后世如果进入银行业，是根本不允许从事其它行业的，这就是监管的必要，毕竟银行已经掌握了大量的资源。
如果让开银行的还可以搞房地产，那根本就不敢想象会是什么结果，所以法律规定银行业是绝对不允许搞房地产的，他们只能给房地产商提供贷款，但是现在大明就是如此。
行商令是对商业行为进行监管，只有监管到位了，才会从商业上面获取大量的税收。
朱由检的行商令只是规范商业行为的第一步，一些普通的行商令在地方官府就可以申请，而且任何地方官府都可以申请，无论是你是哪里的人，但是一些重要的行当，就需要到指定的地方申请。
其中涉及到巨大利润的行业，就需要到南京才可以申请，而且都需要缴纳押金，不然是不允许经营的。
除了行商令，朱由检还对土地政策进行了大规模的改革，这个改革不是重新分配土地，而是对土地进行征税。
这个时代有一个非常奇怪的现象，那就是自耕农需要缴税，但是很多权贵和特权人不需要缴税，往往这些人手中掌握的土地还是最多的。
于是朱由检直接一刀切，只要是大明治下的田地，按照水田旱田，还有杂地进行区分，然后按照每亩交税，这个法令没有特权。
之前大明有很多特权阶层，其中藩王就是其中之一，这些藩王不仅占据了封地大量的土地，而且还贪婪地兼并普通百姓的土地，他们不需要纳税，还要地方税收补充他们的财富。
还有之前入仕为官的官员，一些官员致仕之后，或者是立功了，都会得到赏功田，这些田地也不需要纳税，而且大明有很多这样的田地。
还有一些有权势的地主也逃避征税，于是让大明自耕农凭借少量的土地养活庞大的国家。
朱由检的这个征税的政令不仅涵盖了所有的土地，而且还对征税的数目有着明确的规定，基本原则就是土地越多，征税的赋税越多。
规定超过一百亩的就会征收两成的赋税，如果超过一千亩，就是三成，等到超过五千亩的，将会直接征收五成的赋税。
这样的赋税，对于那些大地主和宗亲藩王无疑是致命的打击，但是眼下的大明朝已经不同于之前了，现在的皇帝朱由检可谓是六亲不认了，这个法令就是对权贵和大地主制定的。
朱由检的新政里面土地改革是最重要的，这个可以抑制土地的兼并，保护自耕农，打击那些圈占土地的地主豪强。
朱由检的这两个法令可谓是从根本上改变了大明朝的现状，当朱由检在朝会上面提出这两个法令之后，百官都被震撼到了。
但是现在大明朝的皇帝非常强势，甚至可以说是独断专行，根本就没有人敢反对，这就是眼下的大明朝。
因为文官集团遭受了重大损失，首先就是北方京城沦陷，大量的文官没有随朱由检南下，最后惨死在京城，让文官集团势力大损。
随着朱由检南下的官员此时还没有形成新的政治集团，而且这些人都是忠义的官员，基本上不会反对朱由检的决定。
至于在江南势力庞大的东林集团，不久之前出现了谋逆弑君的事情，经过一番打压，五十多人被处死或者革职，让东林集团力量大损。
所以现在文官集团非常弱，加上朱由检建立了独立的军队指挥体系，让明军直接听命于皇帝，皇帝的权威更大，完全压倒了文官集团。
大明朝文官压制皇权两百多年的局面此时彻底被打破了，于是朱由检这种触及众多人利益的改革也可以执行了。
这次损失利益最大的当属东林集团，东林人在江南的根基就是地主和商人，所以他们损失最大。
随着明年将执行新政的消息传出，新政的内容也随之被外界得知了，这也是朱由检有意为之，就是想要试探一下民间的反应。
很快，民间就有反映了，普通百姓对于这个新政非常拥护，但是地主商人纷纷反对。
在富庶的苏杭一带，几个地主和当地的几个粮商就联合起来，站出来反对，并且开始囤积粮食，不再出售，让苏杭粮价一路上涨。
他们使用这种方式反抗朝廷的新政，但是很快锦衣卫就找上他们了，几个地主和粮商被通报参与谋逆，暗中出钱资助刘宗周招募死士。
于是一个谋逆的大罪就扣到这几个地主和粮商头上了，几个人完全没有明白过来是怎么回事，就被锦衣卫带走了，他们的家财也全部都被抄没了。
当进入锦衣卫的大牢之后，这几个人悔恨的要命，但是无论如何悔恨，他们再也没能回到家中，被在南京闹市区处斩了。
随着这几个苏杭地主和商人被处死，大明治下突然变得安静了，之前还愤愤不平的商人和地主都安静了。
尤其是东林人，他们此时才明白，原来东林人的谋逆案根本就没有结束，这个谋逆案现在已经是悬在东林人头顶的一把利剑，只要皇帝愿意，随时都可以挥舞一下，剪一下东林人的羽翼。
朱由检知道这几个商人和地主其实没有什么大罪，他们就是囤积粮食，哄抬物价，也罪不至死，但是现在是改革的关键时刻，朱由检必须要使用极端手段稳定局面，同时也是给外面释放一个信号，那就是任何人都无法阻止他的改革。
就在朱由检认为没有人会阻止他的改革，正要准备好好过一个春节的时候，朱由检突然接到急报，那就是两广突然闹起来动乱，桂王朱由榔密谋软禁了两广巡抚苏观生，勾结总兵陈际泰造反了。
并且在福建的郑芝龙也立刻响应，拥护桂王朱由榔为正统，并且训斥朱由检祸国殃民。同时在荆襄的刘宗敏也立刻站出来，要对江南的明朝发动致命一击，贵州夷族也蠢蠢欲动。
突然的变故让南京的气氛顿时紧张起来，江南朝廷的局面一下子陷入了被动之中。
(本章完)