石宝回到杭州就觉得不对劲了，杭州周围根本就没有所谓的西军围城。圣公方腊的圣旨是千真万确的，这到底是怎么回事。
石宝只好向圣公方腊询问来龙去脉。原来是秀州放回了不少俘虏，这些俘虏回到杭州后西军围城的谣言就纷纷扬扬的传开了。杭州四周也出现了几股宋军的先头部队，所以圣公方腊就以为西军真的要来了，所以才要急忙下旨调动历天润再湖州的人马回杭州。
听完方腊的叙述，石宝陷入了沉思，如果方腊当机立断早几天能够召回历天润就好了，如今看来历天润已经是凶多吉少了。于是他对方腊道：“启禀圣公，如今分析历元帅只怕也陷入的西军的重围之中，如今杭州空虚，应尽快迁都睦州，方为上策。”
听石宝这么建议，方腊集团种的各家亲贵、大臣都不愿意了。虽然他们起兵在睦州，而且那里信奉摩尼教的教众甚多。但是杭州的繁华和富贵在江南都是首屈一指的，让这些人进杭州后抢了大批金银美女，强占了大量的豪宅良田。如果让他们放弃现在锦衣玉食、美女豪宅的生活，重新回到小小的睦州，这些人是不愿意的。
没等方腊说话，丞相方肥道：“军师所言差异。杭州如今人马还有10万，粮草尚能支撑1年，城墙高大，万民齐心。如果宋军来攻，圣公一道圣旨，50州县皆派勤王之师，并能将那宋军全歼于城下。何况历元帅不日就可返回杭州，那时杭州有多15万精锐，我朝稳如泰山，何须迁都。”
石宝一听就明白方肥的意思，杭州10万人马，很多都是从秀州放出来的老弱残兵，这些人还能又多少战斗力？方肥是心知肚明的，只是不愿放弃眼前的富贵而已。历天润大概率是回不来了，勤王之师更是不靠谱的事情。唯一可以靠的就是城高墙厚，但是这城墙能够挡住西军的轰天雷吗？石宝一点把握都没有。
石宝看了一眼当场诸大臣，从他们的表情看大概他们都支持方肥。石宝暗道：这些人没有西军交过手，不知道这只军队的厉害。石宝也不想跟这些见识短浅的大臣们斗嘴，他要说服的实方腊，只要方腊同意迁都睦州，凭着自己的智谋和当地摩尼教众的支持起义军就地与宋军周旋还有获胜的语言，如果坐守孤城那一切就都完了。
于是石宝对方腊道：“圣公，击败方貌（就是方七佛）的军队师宋朝最精锐的西军，这只军队与其他军队不同，非常骁勇，不可强敌。为今之计，只有退回老家睦州，在与之慢慢周旋。请圣公三思。”
石宝是方腊封的护国军师，方腊自起义以来文官依靠石宝，武将依靠历天润，在起义前期可以说是攻无不取、战无不胜，最终占领了52个州县。不过方腊攻占杭州之后，建立的永乐朝廷，开始大力提拔方氏族人。文官提拔了丞相方肥位置石宝之上，武将提拔了都元帅方七佛位在历天润之上。方腊本想朝廷在方式一族的掌握中，能够江山稳固。没想到，最近方七佛被杀，历天润不知行踪，弄得方腊也郁闷无比。他此刻想起在睦州起义之后，石宝可以说是算无遗策，今天石宝再三要求要他迁都，他也有些犹豫了。
方腊犹豫之间，可急坏了方肥等人，他们真的不像放弃杭州的荣华富贵。方肥急忙示意儿子方杰，让他说话。方杰是方腊侄子，方杰身材十分高大，别说实在江南，他的个头就是跟西军将士比也算是高个子了。平时用一杆方天画戟，是追随方腊起义的骁将。
方杰见父亲方肥的眼神就明白了，于是说道：“军师怎么胆小起来了，当初睦州起义之时，咱们把宋军杀的丢盔弃甲，如今秀州刚遇小挫，就胆小起来了？”
方杰还是方氏家族众比较有作为的将军，石宝平时也很是看重方杰。没想到今日方杰竟然跟方肥一起质疑自己，不由得怒从心头起，他指着方杰，道：“宋廷西军之强悍，岂是你等所知。如此贪恋此地富贵，只怕死无葬身之地！”
石宝虽然是指着方杰在说，但是这话意思却是指着朝堂中的诸大臣讲的。所以，当他话音未落，朝堂上的诸人以方肥为首，纷纷指责气石宝来了。
方腊见朝堂上乱成一片，不由大怒，用力拍了一下龙书案，喝道：“成何体统！”
众人见方腊发火，这才停了下来。方腊看了一眼众人，道：“兵书云：兵来将挡水来土掩。杭州兵精粮足，城高墙厚，孤又有神兵相助，有何惧哉。况且我也派人王寅、司厅方、庞万春联络太湖混江龙、山东及时雨、还有西夏国主，请他们前来相助，等外援一来，内外夹攻定能让宋廷军队全军覆没。传旨，令丞相方肥统领守城一切之事。退朝。”言罢，一抖袍袖，头也不回的走了。
诸大臣也纷纷离去，朝堂上只留下石宝一人发呆。过了好久，石宝无奈摇摇头，他知道起义军完了，于是落寞的离开了。
时迁跟随着释放的战俘顺利的混进了杭州，到了杭州他带着的10人的锦衣卫在杭州各地画图。从秀州出来的时候，他们带着官绘的杭州地图，但是杭州现在已经是起义军的都城了，很多地方改变了不少。比如原来知府衙门让起义军扩建了以后就变成了圣公府，知县衙门变成了丞相府，还有将军府、元帅府什么的，这几天时迁带着人都在原有的地图上描绘了出来。最重要的他们还探查出了一部分诸如兵营、武器库之类的重要军事设施所在。
时迁算着时日，觉得应该把这个地图传递出去了。这天他们几个人正在商量如何把这个消息送出城的时候，有一个锦衣卫匆匆忙忙跑了进来。
这个锦衣卫对时迁道：“百夫长大人，我有探听道一个消息，这两天贼军的护国军师回来了。”
混入战俘营之后，时迁很快就探听到石宝其实就在这个方七佛的队伍中，只不过秀州之战的时候跑掉了。时迁等人到了杭州几乎把所有主要官员的府邸都探听到了，就是没找到护国军师府。多方打听似乎就没有这么一个府，时迁本想跟踪这个护国军师，但是护国军事根本就没回来。
这次听说石宝回来了，时迁大喜，只要探听好了石宝的府邸，这份地图就完美了。于是时迁道：“我明天就去知府衙门那里守着，一定探听到石宝的住所。”
石宝走出了圣公府，坐上了一辆不起眼的马车。这辆马车是石宝特意打造的，马车外表看起来非常普通，可是内饰豪华无比。他坐上了马车，轻轻的对车把式说：“回府。”此时，他完全没有主意道时迁已经跟在了后面。
石宝是个谨慎的人，他不像其他的义军将领一进杭州就拼命的抢豪宅、占良田、夺金银、霸美女。他金银美女抢了一些，豪宅良田却没抢。他看到起义军到杭州后烧杀抢掠，总觉得在这里呆不久长，豪宅、良田只是身外之物到时候带不走总是累赘，不如多抢一些金银美女更加实惠。他抢的这些金银美女都放在一个悦来客栈后院，平时他就住在这个不起眼的地方。客栈上下都换上了他的亲信，前院平时还看起来还在营业，只是不怎么接待客人而已。
时迁看着石宝走进了悦来客栈，不禁暗自吃惊，他也不能确定石宝的军师府就藏在这个客栈里。但是他远远的看过去这个客栈的伙计都是孔武有力的，对待客人也不像其他客栈伙计那样热情，因此断定了八九不离十。
时迁并没有贸然进入悦来客栈，而是悄悄的回到自己的住所。他对手下说道：“我估计这个石宝的军师府暗藏在悦来客栈内。但是也不确定，今晚我想夜探悦来客栈。如果我回不来，这个悦来客栈就算不是军师府，也必然有蹊跷，你们不必着急救我，明日务必先把地图送出去。”
是夜，石宝异常烦躁，他对起义军的前程非常担心，也对抢来的金银和美女不知道未来会流落何方感到无奈。突然他想到了一条计策，不由得嘴边泛起一丝微笑，心情随即大好起来。他刚刚要吩咐手下给他送一个美女来享受一番，这时候管家来报，说是方杰求见。
石宝听说方杰求见心中大喜，本来他的计策就是要要与方杰商议。于是赶紧命人把方杰请了进来。
方杰进得石宝屋子里不禁皱起眉头，道：“石宝啊，你好歹也是护国军师，看看住这个破房子。”说吧也不等石宝谦让，抓起桌子上的官窑的细瓷茶盅就喝起茶来。
石宝看着方杰，随口说道：“这比睦州老家的房子好多了。方大将军为何深夜来访，是方肥让你来的吗？”
方杰道：“非也，是圣公让我来的。”
石宝急忙问道：“圣公有何旨意。”
方杰道：“啥旨意也没有。我叔叔让我看看你。他说他今天并不是在朝堂上故意冷落你，而是现在睦州老弟兄刚刚在杭州过了几天的好日子，现在撤回睦州，恐伤了众人之心。他让我劝劝你，还要跟我父亲同心协力，守住杭州为好。”
石宝他了口气道：“杭州虽好，可是孤城难守。而且尔等没跟西军交过手，不知道西军的厉害……”
石宝还要继续说，方杰抬手阻止了他说话：“他们能厉害道那里去，还能比神兵厉害。圣公练成的神兵可是刀枪不入的。”
“神兵？”石宝哼了一声，道：“难道我打仗要靠哪些行尸走肉吗？”
方杰继续说道：“圣公已经派王寅等人联系太湖的混江龙，山东的及时雨，甚至西夏国，这这些好汉都号称有数千马步兵，届时一并来援……”
“混江龙、及时雨皆是乌合之众，乌合之众，不值一提。那西夏国远在天边，怎能依靠！”石宝连忙阻止道。他此刻已经意识到方腊集团必然失败了，混江龙、及时雨这水匪山贼肯本没有到杭州胆量与官兵正面作战。那西夏国更是远在千里之外，如何到杭州都是问题。
石宝心里下定决心，决定再争取最后一搏。如果赢了最好，如果失败，先保住自己性命再说。于是他继续道：“我有一计与将军商量，或许可使杭州转危为安。”